Les protozoaires sont des organismes de petite taille (mais pas simples). Ce sont des eucaryotes hétérotrophes unicellulaires, qui se nourrissent de bactéries et d'autres sources de nourriture.

Il s'agit d'un terme ancien, et le terme plus large de protiste est généralement préféré aujourd'hui. Toutefois, le terme "protozoaire" est souvent utilisé par commodité, en particulier dans l'enseignement primaire. Il s'agit d'un terme général plutôt commode, mais les "protozoaires" sont en fait classés en plusieurs catégories.

Le terme est problématique car les techniques biochimiques et génétiques modernes montrent qu'il comprend plusieurs types de cellules très différentes. On les trouve uniquement dans les habitats humides ou aquatiques. De nombreuses espèces de protozoaires sont des symbiotes, certaines sont des parasites et d'autres sont des prédateurs de bactéries et d'algues du sol. Il existe environ 30 000 espèces de protozoaires.