Le comté d'Atchison (code de comté AT) est un comté du nord-est du Kansas, dans le centre des États-Unis. En 2010, 16 924 personnes y vivaient. Le siège du comté est Atchison. Atchison est également la plus grande ville du comté. Le comté porte le nom de David Rice Atchison, un sénateur américain du Missouri.