Une souris knockout est une souris génétiquement modifiée dans laquelle un ou plusieurs gènes ont été éteints par un knockout.

Les souris knockout sont des modèles animaux importants pour l'étude du rôle des gènes qui ont été séquencés mais dont les fonctions ne sont pas encore connues. En rendant un gène spécifique inactif chez la souris et en observant les différences par rapport au comportement ou à l'état normal, les chercheurs peuvent déduire sa fonction probable.

Les souris sont actuellement l'espèce d'animal de laboratoire la plus proche de l'homme pour laquelle la technique d'élimination peut facilement être appliquée. Elles sont largement utilisées dans les expériences de knockout, en particulier pour les questions génétiques liées à la physiologie humaine.

L'extinction des gènes chez les rats est beaucoup plus difficile et n'est possible que depuis 2003.

La première souris knock-out a été créée par Mario R. Capecchi, Martin Evans et Oliver Smithies en 1989, pour laquelle ils ont reçu le prix Nobel de physiologie ou de médecine en 2007.

Une explication détaillée du mode de production des souris knockout (KO) se trouve sur le site web du Prix Nobel de physiologie ou médecine 2007.

Certains aspects de la technologie permettant de générer des souris knock-out, et les souris elles-mêmes, ont été brevetés dans de nombreux pays par des entreprises privées.