En biologie, une colonie désigne un mode de vie ou une habitude où des membres d'une même espèce vivent ensemble.

En général, les membres d'une colonie sont génétiquement liés par une hérédité commune. Parfois, comme pour les bryozoaires, ce sont des clones génétiquement identiques, parfois, comme pour l'eusocialité, ce sont des membres d'une famille élargie. Parfois, comme dans le cas du Man o' War portugais, les membres de la colonie sont réunis en un seul individu, qui fonctionne comme une seule unité.

La plupart des colonies des groupes énumérés ci-dessous construisent une structure ou un nid commun. Parfois, elles ne sont liées que par leur comportement. L'intégration étroite des termites, des fourmis, des abeilles et des guêpes est appelée eusocial.

Le terme s'applique principalement aux animaux, bien qu'il existe quelques protistes et procaryotes qui vivent en colonies.