Pontarlier est une commune française du département du Doubs, région Bourgogne-Franche-Comté, dans l'est de la France, près de la frontière avec la Suisse. C'est une sous-préfecture du département et c'est aussi le chef-lieu de l'arrondissement de Pontarlier.

Pontarlier est la troisième commune du département par sa population, après Besançon et Montbéliard.