Les étapes ci-dessous ne sont décrites que dans les grandes lignes. Les laboratoires qui font de l'histologie travaillent à partir d'horaires beaucoup plus détaillés.
Correction
Des fixateurs chimiques sont utilisés pour préserver les tissus de la décomposition. Cela préserve la structure de la cellule et des composants sous-cellulaires tels que les organites cellulaires (par exemple, le noyau, le réticulum endoplasmique, les mitochondries). Le fixateur le plus courant pour la microscopie optique est le formol (4 % de formaldéhyde dans une solution saline).
Incorporation
Après fixation, le bloc de tissu est encastré dans de la cire de paraffine. Cela permet de maintenir et de préserver le tissu en tant que bloc.
Sectionnement
La section est découpée en une série de tranches très fines, chacune d'entre elles étant placée sur une lame de microscope en verre. La machine qui coupe le bloc est une guillotine mécanique qui peut être réglée pour couper à une profondeur appropriée pour le tissu en question.
Coloration
Les taches sont des colorants, des produits chimiques utilisés pour rendre les cellules et les tissus faciles à voir au microscope. Il existe de nombreuses taches sur les tissus, et chacune d'entre elles présente des avantages et des inconvénients.
Hématoxyline et éosine (H&E)
C'est la tache la plus utilisée en biologie et en médecine. L'hématoxyline colore le noyau des cellules et l'éosine colore le cytoplasme des cellules.
Nitrate d'argent
Camillo Golgi a mis au point une coloration au nitrate d'argent pour les cellules nerveuses. Son idée a été utilisée par Santiago Ramón y Cajal dans son célèbre travail sur la structure du tissu cérébral.