Le transfert horizontal de gènes (HGT) (ou transfert latéral de gènes) est un processus par lequel un organisme obtient du matériel génétique d'un autre organisme sans être la progéniture de cet organisme.

En revanche, le transfert vertical se produit lorsqu'un organisme reçoit du matériel génétique de son ancêtre, par exemple de son parent ou d'une espèce dont il est issu.

La plupart des réflexions en génétique se sont concentrées sur le transfert vertical, mais il y a une prise de conscience croissante que le transfert horizontal de gènes est un phénomène important. Parmi les organismes unicellulaires, il pourrait être la forme dominante de transfert génétique. Le transfert horizontal artificiel de gènes est une forme de génie génétique.