La flore vaginale ou microbiote sont de minuscules microorganismes qui font partie des organes reproducteurs sains chez la femme. Les humains possèdent de nombreux organismes de très petite taille qui font partie du corps humain normal. Ces microorganismes ne peuvent être observés qu'avec un microscope. Ces organismes sont des bactéries et des champignons. Presque tous ne provoquent pas de maladies, mais il est quand même normal de les avoir à l'intérieur ou à l'extérieur du corps.
Ces petits microorganismes sont appelés microbiote par les chercheurs. Il y a des microbiotes dans l'estomac, la peau, la bouche, les yeux, et des microbiotes dans le vagin. Le microbiote chez l'homme aide à stopper les infections causées par d'autres bactéries. Le microbiote vaginal aide à maintenir le vagin en bonne santé. Ils aident à prévenir les infections causées par d'autres bactéries. Les bactéries qui provoquent des maladies ou des infections sont appelées pathogènes. Le microbiote vaginal normal arrête la croissance des agents pathogènes.
Lorsqu'une femme consulte un médecin parce qu'elle a du liquide qui sort de son vagin, le médecin peut lui faire passer un test de dépistage des bactéries pathogènes. Les agents pathogènes peuvent se développer trop rapidement. Ils peuvent se développer plus rapidement que le microbiote vaginal normal et sain. Une infection peut faire sortir du liquide du vagin. C'est ce qu'on appelle les pertes vaginales. Une bonne bactérie saine qui protège le vagin des maladies est appelée Lactobacillus. Il existe d'autres bonnes bactéries qui maintiennent le vagin en bonne santé. Voici quelques-uns de leurs noms : Peptostreptococcus, Propionibacterium et Actinomyces.
Si une femme attrape une maladie sexuellement transmissible, cela va modifier le microbiote vaginal. Le microbiote vaginal sain ne peut pas arrêter ou guérir une infection sexuellement transmissible.

