Le trypanosome est un genre de protozoaires parasites. Il existe dans la classe des Kinetoplastida. Il s'agit d'un groupe monophylétique de protozoaires flagellés parasites unicellulaires. Tous les trypanosomes ont besoin de plus d'un hôte particulier pour accomplir leur cycle de vie.
La plupart sont transmises par un vecteur, généralement par des invertébrés se nourrissant de sang. Il existe différents mécanismes parmi les différentes espèces. Chez un hôte invertébré, ils se trouvent généralement dans l'intestin, mais chez leur hôte mammifère, ils vivent généralement dans le sang ou à l'intérieur des cellules.
Les trypanosomes infectent une variété d'hôtes et provoquent diverses maladies, notamment les maladies humaines mortelles que sont la maladie du sommeil, causée par Trypanosoma brucei, et la maladie de Chagas, causée par Trypanosoma cruzi.
Le génome mitochondrial du trypanosome, et d'autres cinétoplastides, est constitué d'une série très complexe de cercles et de minicercles. Il a besoin de nombreuses protéines pour s'organiser pendant la division cellulaire.