Saison 2006
Vitantonio Liuzzi et Scott Speed étaient les pilotes de la course 2006, avec Neel Jani dans le rôle de pilote d'essai/troisième pilote. Vitantonio Liuzzi avait couru à temps partiel pour Red Bull Racing en 2005, tandis que Scott Speed était entré en F1 suite à la recherche de pilotes Red Bull aux États-Unis. Jani était le pilote d'essai pour Sauber Petronas en 2004.
Le châssis Toro Rosso 2006 était une version modifiée de la Red Bull Racing RB1 2005. Certaines équipes ont estimé que cela enfreignait la règle selon laquelle chaque équipe doit concevoir sa propre voiture. Toro Rosso affirme que cette conception a été produite pour la première fois en 2004 par Jaguar Racing, le prédécesseur de Red Bull. Elles estimaient que les droits de conception avaient appartenu à la Ford Motor Company, la société mère de Jaguar Racing, avant de passer à Toro Rosso.
Le nouveau règlement de la Formule 1 pour 2006 exige de nouveaux moteurs V8. Toro Rosso a été autorisé à utiliser les moteurs V10 Cosworth de 3 litres de Minardi, dont la puissance est limitée. Cette option avait été créée pour aider les équipes les moins bien financées à faire face aux dépenses liées à la construction de nouveaux moteurs. La Formule 1 a permis à Toro Rosso d'utiliser cette option après que le rachat de Red Bull ait causé des frictions avec d'autres équipes, en particulier Super Aguri et Midland. Ces équipes ont estimé que le moteur donnait à Toro Rosso un trop grand avantage. Elles ont regretté que la concession permettant à l'équipe d'utiliser le moteur V10 soit basée sur la mauvaise situation financière de Minardi, et n'aurait pas dû s'appliquer après le rachat de l'équipe par Red Bull.
Saison 2007
Pour la saison 2007, Toro Rosso a commencé à utiliser le moteur V8 Ferrari 056, reprenant le contrat que Red Bull Racing a rompu en passant aux moteurs Renault.
Lors du lancement de la STR2 le 13 février, Gerhard Berger a confirmé Liuzzi comme pilote 2007. Lors des tests effectués à Bahreïn le 24 février, Scott Speed a été confirmé comme deuxième pilote de l'équipe. Sébastien Bourdais, triple champion de Champ Car, a été le pilote d'essai non officiel à plusieurs reprises au cours de la saison.
La saison 2007 a été globalement décevante. L'équipe a souffert d'un manque de fiabilité et d'erreurs de la part des pilotes, ce qui a entraîné un faible nombre d'arrivées en course. À la suite du Grand Prix d'Europe, Scott Speed a été retiré de la liste des pilotes. Il a été remplacé par Sebastian Vettel, pilote de développement de BMW Sauber. Sebastian Vettel a ensuite été confirmé comme pilote pour 2008.
Au Grand Prix de Chine, Toro Rosso a obtenu ses meilleurs résultats. Vettel a terminé quatrième et Liuzzi sixième, marquant ainsi huit points pour l'équipe. Ce sont également les meilleurs résultats des pilotes en Formule 1. C'était une grande amélioration par rapport à la course précédente. Au Grand Prix du Japon, Vettel a percuté la Red Bull de Mark Webber dans les conditions d'une voiture de sécurité (full course yellow). Webber courait en deuxième position, et Vettel était en troisième position. Liuzzi a perdu la possibilité de marquer un point après une pénalité de 25 secondes. Il a été pénalisé pour avoir dépassé le Spyker d'Adrian Sutil pour la huitième place dans des conditions de drapeau jaune local. Cette pénalité l'a fait rétrograder à la neuvième place.
Saison 2008
Les pilotes de la Scuderia Toro Rosso pour 2008 étaient Sebastian Vettel et Sébastien Bourdais. Bourdais a obtenu ses premiers points en F1 avec une 7e place au Grand Prix d'Australie. Vettel a marqué ses premiers points de la saison avec une 5e place au Grand Prix de Monaco.
L'équipe a subi un choc énorme lors du Grand Prix d'Italie, qui s'est déroulé sous la pluie. Vettel s'est emparé de la pole position et a remporté la course. C'était la première pole position et la première victoire pour lui et Toro Rosso. C'était également la première victoire pour un moteur Ferrari dans un châssis client. Les performances de Vettel lui ont valu une place chez Red Bull Racing pour 2009.
Saison 2009
Avec le passage de Vettel à Red Bull Racing, Sébastien Buemi et Sébastien Bourdais ont été les pilotes de Toro Rosso pour 2009. Avant le début de la saison, le patron de l'équipe, Franz Tost, a déclaré qu'il serait "difficile" de faire aussi bien que lors de la saison 2008. Le 16 juillet, Toro Rosso a annoncé que le contrat de Bourdais était résilié. Le 20 juillet, l'équipe a annoncé que Jaime Alguersuari remplacerait Bourdais à partir du Grand Prix de Hongrie.
La saison s'est terminée avec le Toro Rosso qui a terminé à la dernière place du championnat. Force India a pu prendre les devants dans la course aux points après avoir terminé deuxième au Grand Prix de Belgique. À la fin de la saison, Sébastien Buemi a pu marquer des points dans les deux dernières courses. Jaime Alguersuari n'a pas réussi à marquer de points au cours de la saison.
La controverse a porté sur le fait de savoir si l'équipe avait ou non gâché ses chances en ayant deux pilotes inexpérimentés car leur voiture avait essentiellement le même ADN que ce que l'on dit être le meilleur sur la grille, la RB5 de Redbull Racing.
2010
La Scuderia Toro Rosso a confirmé qu'elle garderait Sébastien Buemi et Jaime Alguersuari pour 2010. En vertu des nouvelles réglementations, ils ont également dû construire et concevoir leur propre voiture sans l'aide de Red Bull Technology, les premières équipes depuis Minardi. Alguersuari a marqué les premiers points de sa carrière en terminant neuvième au Grand Prix de Malaisie. Ils ont continué à réaliser de mauvaises performances tout au long de la saison en la mélangeant occasionnellement avec les saubers, Force Indias et Vitaly Petrov. Cependant, ils ont été continuellement le "pilote" qui a quitté les premières qualifications avec les trois nouvelles équipes.
Avenir à long terme
Le contrat de 2008 entre la FIA et les écuries de Formule 1 interdisant les voitures des clients à partir de 2010. Pour cette raison, Red Bull a mis en vente l'équipe Toro Rosso en mars 2008. Ils avaient espéré vendre l'équipe avant la fin de la saison 2009. Le 3 janvier 2011, des rumeurs ont circulé selon lesquelles un acheteur avait été trouvé.