Un chromophore est la partie d'une molécule responsable de sa couleur.

La couleur est causée par l'absorption de certaines longueurs d'onde de la lumière visible par une molécule. Elle ne transmet ou ne réfléchit que d'autres longueurs d'onde, ce qui provoque la couleur que nous voyons.

Dans les molécules biologiques qui captent ou détectent l'énergie lumineuse, le chromophore est la partie de la molécule qui réagit lorsqu'elle est frappée par la lumière.

Les chromophores sont les cellules contenant des pigments et réfléchissant la lumière que l'on trouve chez de nombreux animaux.