Un cofacteur (ou cofacteur) est un composé chimique qui n'est pas une protéine, mais qui est attaché à une protéine. Le composé est nécessaire à l'activité biologique de la protéine. Dans la plupart des cas, la protéine sera une enzyme, et le cofacteur aidera l'enzyme à travailler. Dans ce cas, les cofacteurs sont également appelés coenzymes.

Les cofacteurs qui sont des molécules organiques complexes sont souvent appelés coenzymes. S'ils sont reliés par une liaison covalente, ils constituent un groupe prothétique. Mais s'ils ne sont reliés que temporairement, le cofacteur est un cosubstrat.

Certaines enzymes ont besoin de plusieurs cofacteurs. Les cofacteurs organiques sont souvent des vitamines, ou fabriqués à partir de vitamines. Les ions métalliques sont souvent des cofacteurs, mais de nombreux cofacteurs ont des parties à la fois inorganiques et organiques.