En 1989, Soundgarden a sorti son premier album pour un grand label, A&M Records. Louder Than Love est devenu le premier album du groupe à figurer au palmarès du Billboard 200. Il a atteint la 108e place du hit-parade en 1990. Le groupe a fait la promotion de l'album lors de tournées en Amérique du Nord et en Europe.
Un mois avant le début de la tournée de Louder Than Love, le bassiste Hiro Yamamoto est parti pour retourner à l'université. Yamamoto était malheureux car il estimait ne pas être assez important pour le groupe. L'ancien bassiste de Nirvana, Jason Everman, a pris sa place pour la tournée. Everman a été licencié immédiatement après le retour de Soundgarden d'Europe au milieu des années 1990. Un EP Loudest Love et la compilation vidéo Louder Than Live, sont tous deux sortis en 1990. La vidéo montre cinq morceaux live réalisés lors de la tournée Louder Than Love.
Badmotorfinger : 1990-1993
Le bassiste Ben Shepherd a rejoint Soundgarden en 1990. Leur album suivant, Badmotorfinger, est sorti en 1991. Il a connu un certain succès, atteignant la 39e place du classement des albums. Mais il a moins retenu l'attention en raison du succès surprise de Nirvana's Nevermind, sorti le même mois que Badmotorfinger. Deux singles ont été diffusés sur des stations de radio alternatives et sur MTV.
Le premier single de Badmotorfinger, "Jesus Christ Pose", a reçu une attention négative lorsque MTV a interdit son clip musical en 1991. De nombreux auditeurs ont été indignés par la chanson et son clip, le qualifiant d'anti-chrétien. Le groupe a reçu des menaces de mort lors d'une tournée au Royaume-Uni pour soutenir l'album. Badmotorfinger a été nominé pour un Grammy Award de la meilleure performance métal en 1992.
Après une tournée en Amérique du Nord en 1991, le groupe a fait la première partie de Guns N' Roses en Amérique du Nord lors de la tournée "Use Your Illusion Tour". Après plusieurs tournées pour promouvoir l'album, ils ont rejoint Guns N' Roses à l'été 1992 en Europe dans le cadre de la tournée "Use Your Illusion Tour" avec une autre première partie, Faith No More. Le groupe a pris part à la tournée Lollapalooza de 1992 avec les Red Hot Chili Peppers, Pearl Jam et Ministry.
Le groupe a ensuite sorti une compilation vidéo Motorvision. Elle a été réalisée en 1992 au théâtre Paramount. Cette même année, ils apparaissent dans le film Singles. Ils jouaient dans le spectacle "Birth Ritual". La chanson apparaît sur la bande-son, tout comme une chanson solo de Chris Cornell, "Seasons".
Super inconnu : 1994-1995
Soundgarden a sorti Superunknown en 1994. Il est devenu l'album le plus vendu du groupe, en partie grâce aux singles populaires "Black Hole Sun", "Spoonman", "My Wave" et "Fell on Black Days". Lors de sa sortie en mars 1994, Superunknown s'est retrouvé en première place du classement des albums du Billboard 200.
Les paroles des chansons étaient sombres et tristes ; la plupart d'entre elles semblent parler de toxicomanie, de suicide et de dépression. Le critique J.D. Considine de Rolling Stone a déclaré que Superunknown "démontre une portée bien plus grande que ce que beaucoup de groupes réussissent à faire en une carrière entière". Il a également déclaré : "Dans le meilleur des cas, Superunknown offre une représentation plus poignante de l'aliénation et du désespoir que tout ce qui se trouve sur In Utero."
Le clip musical de "Black Hole Sun" a reçu le MTV Video Music Award pour le "Meilleur clip rock|Meilleur clip métal/hard rock" en 1994. Soundgarden a remporté deux Grammy Awards en 1995 ; "Black Hole Sun" a reçu le prix de la meilleure performance hard rock et "Spoonman" celui de la meilleure performance métal.
Le bon côté des choses : 1996-1997
Après une tournée mondiale pour promouvoir Superunknown, les membres du groupe ont commencé à travailler sur ce qui allait devenir leur dernier album studio pendant plus de 15 ans. Il est sorti en 1996. Quatre singles sont sortis de l'album : "Pretty Noose", "Blow Up the Outside World", "Burden in My Hand" et "Ty Cobb".
La musique était moins heavy metal et grunge que les albums précédents du groupe. Les membres du groupe ont dit qu'ils voulaient expérimenter d'autres sonorités. Dans une critique, David Browne de Entertainment Weekly a déclaré : "Peu de groupes depuis Led Zeppelin ont mélangé des instruments aussi précis, à la fois acoustiques et électriques". Cependant, l'écriture et l'enregistrement de l'album ont été stressants pour le groupe. Thayil et Cornell ne semblaient pas d'accord sur un changement des riffs de guitare lourds qui étaient devenus la marque de fabrique du groupe. L'album reçoit des critiques favorables, mais ne se vend pas aussi bien que Superunknown.
Le groupe a joué lors de la tournée Lollapalooza de 1996 avec Metallica, qui leur avait demandé de se produire. Après Lollapalooza, le groupe est parti pour une tournée mondiale. Les tensions ont continué à augmenter pendant la tournée. Lorsqu'on lui a demandé si le groupe détestait les tournées, Cornell a répondu : "Nous aimons vraiment ça jusqu'à un certain point et puis ça devient ennuyeux, parce que ça devient répétitif. On a l'impression que les fans ont payé leur argent et qu'ils s'attendent à ce que vous veniez leur jouer vos chansons comme la première fois que vous les avez jouées. C'est le point où nous détestons les tournées". Lors de la dernière étape de la tournée à Honolulu, Hawaii, le 9 février 1997, Shepherd a lancé sa guitare basse en l'air, frustré par la défaillance de son équipement. Il a alors quitté la scène en trombe. Le groupe a alors également quitté la scène, mais Cornell est revenu pour jouer un solo en rappel.