Le Scarborough était l'un des six navires de transport de prisonniers de la Première flotte. La Première flotte transportait les condamnés et les soldats en Australie pour y fonder une colonie pénitentiaire. Les navires ont quitté l'Angleterre en mai 1787 et sont arrivés en Australie en janvier 1788. Ce fut le début de la colonisation européenne de l'Australie.
Le Scarborough était un navire de 430 tonnes sous le commandement de John Marshall. Il mesurait 34 m de long et 9 m de large. Le pont de la prison était très petit et exigu. La hauteur de l'espace n'était que de 135 cm (53 po). Le navire avait un contrat avec le gouvernement britannique pour le transport des prisonniers. Les propriétaires étaient payés au taux de 10 shillings par tonne et par mois. Ils devaient accepter de garder les prisonniers en sécurité et de les mettre en sûreté. Après avoir transporté les condamnés en Nouvelle-Galles du Sud, le Scarborough était sous contrat pour travailler pour la Compagnie des Indes orientales.
Scarborough quitte l'Australie le 5 mai 1788, et avec le Lady Penrhyn, s'embarque pour la Chine. Le 17 mai 1788, elle débarque à l'île de Lord Howe pour les oiseaux et les légumes, et rentre en Angleterre le 15 juin 1789.