Très sociaux, les chiens de prairie vivent en grandes colonies - des collections de familles de chiens de prairie qui peuvent s'étendre sur des centaines d'hectares. Les familles sont généralement composées d'un mâle et de deux à quatre femelles vivant dans une stricte hiérarchie sociale. Les chiots des chiens de prairie atteignent leur maturité sexuelle vers l'âge de 3 ans, et après leur troisième hiver, le mâle dominant d'une famille donnée les chasse, les obligeant à fonder leur propre famille en bordure de la colonie. Le mâle dominant défendra les frontières de la famille contre les chiens de prairie rivaux, et les disputes sont résolues par des combats. Les chiens de prairie sont également agressifs contre les prédateurs tels que les blaireaux et les serpents.
Les chiens de prairie sont des animaux sociaux, ils se rendent souvent visite et se saluent par une sorte de baiser. Les chiens de prairie utilisent une forme de communication complexe qui implique des aboiements et des gazouillis rythmés.
Les systèmes de tunnels pour chiens de prairie comportent généralement plusieurs pièces. Les tunnels peuvent descendre jusqu'à 5 mètres et peuvent s'étendre latéralement jusqu'à 30 mètres. Les chiens de prairie tapissent leur terrier d'herbe pour l'isoler, et la terre extraite du terrier est empilée en monticules autour de l'entrée du terrier. Les chiens de prairie utilisent ces monticules soigneusement entretenus comme postes d'observation.
Le chien de prairie est bien adapté aux prédateurs. Il peut détecter les prédateurs à distance et alerter les autres chiens de prairie du danger par un appel spécial et aigu. Les chiens de prairie utilisent différents appels pour identifier des prédateurs spécifiques. Les chiens de prairie coupent également la végétation autour de leurs colonies, peut-être pour éliminer tout abri pour les prédateurs. Leurs terriers contiennent généralement plusieurs voies de fuite.
Le chien de prairie est principalement herbivore, bien qu'il mange quelques insectes. Il se nourrit principalement d'herbes et, à l'automne, de plantes à feuilles larges. Les chiens de prairie ont de 1 à 6 petits (bébés) par an, qui naissent aveugles et sans poils et ont besoin d'environ 30 jours d'éducation rapprochée de leur mère.
Parfois, deux chiens de prairie se touchent les dents. Les chercheurs pensent qu'ils font cela pour se reconnaître.