L'heure exacte de la frontière entre le Phanérozoïque et le Protérozoïque est légèrement incertaine. Au XIXe siècle, la limite a été fixée aux premiers fossiles métazoaires abondants. Mais plusieurs centaines de types de métazoaires du Protérozoïque ont été découverts dans l'Édiacarien. L'étude du biote d'Ediacaran a commencé dans les années 1950. Il y a trois points de division à la frontière entre le Protérozoïque et le Phanérozoïque. Il peut s'agir de l'endroit où les premiers trilobites et archéocyatha apparaissent, ou de la première apparition de signes de fouille, ou encore de la première apparition de la "petite faune des étagères". Les trois différents points de division se trouvent à quelques millions d'années d'intervalle.
Au Phanérozoïque, la biodiversité a énormément augmenté :
- l'émergence rapide de phyla animaux ;
- l'évolution de ces phyla en diverses formes ;
- l'émergence de plantes terrestres ;
- le développement de plantes complexes ;
- l'évolution des poissons ;
- l'émergence d'animaux terrestres ; et
- le développement des faunes modernes.
Au cours de la période couverte, les continents ont dérivé, pour finalement se rassembler en une seule masse terrestre connue sous le nom de Pangée, puis se diviser en masses terrestres continentales actuelles.
Le Phanérozoïque est divisé en trois ères : le Paléozoïque, le Mésozoïque et le Cainozoïque.