Le comté de Harju (en estonien : Harju maakond) est l'un des 15 comtés d'Estonie. Il se trouve dans le nord de l'Estonie. Environ 528 468 personnes vivent dans le comté de Harju. Cela représente environ 39,4 % de la population totale de l'Estonie (en janvier 2011).

Il existe un certain nombre de zones protégées dans le comté de Harju. Le parc national de Lahemaa a été le premier parc national de l'Union soviétique. Il y a 21 réserves naturelles et 25 zones de protection du paysage, qui se trouvent au moins en partie dans le comté de Harju. La plus grande est la réserve naturelle de Põhja-Kõrvemaa.