Les Charophyceae sont les algues vertes les plus proches des plantes.
Leur rang exact fait l'objet d'un débat. Certains botanistes recommandent d'étendre le règne végétal existant pour y inclure les charophytes et les chlorophytes.
D'autres classent les Charophyceae comme une classe dans la division Charophyta, les Chlorophyta restant une division distincte. Il existe également d'autres possibilités.
Le consensus parmi les botanistes est que les charophytes sont les organismes les plus étroitement liés aux plantes terrestres (embryophytes).
De nombreux traits végétaux complexes liés à la reproduction sexuée ont d'abord évolué chez les charophycées. L'analyse de l'ADNcp (ADN des chloroplastes) montre que les caractéristiques des chloroplastes végétaux ont également évolué en premier chez les charophycées, avant que les zygnémate ne s'écartent de la lignée qui conduit aux coléoptères, aux charales et aux plantes terrestres.
Les groupes généralement inclus dans les Charophyceae sont :


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