Linux Mint est basé sur Ubuntu et les deux distributions ont beaucoup en commun. Les deux distributions utilisent les mêmes dépôts de logiciels. Par exemple, la version 2.2 ("Bianca") utilise les pools de paquets d'Ubuntu "Edgy Eft" (6.10). La plupart des paquets sont identiques sur les deux distributions et les deux systèmes se comportent presque de la même manière.
La plupart des différences se trouvent sur le bureau. Ubuntu et Linux Mint sont tous deux axés sur la convivialité, mais Linux Mint offre une expérience utilisateur différente, et il comprend un certain nombre d'applications qui ne sont pas disponibles dans Ubuntu (voir les outils Mint mentionnés ci-dessus).
De nombreux codecs multimédia populaires sont installés par défaut dans Linux Mint. Ubuntu, et de nombreuses autres distributions GNU/Linux gratuites, ne distribuent pas ces codecs avec le support d'installation initial en raison de problèmes d'encombrement des brevets.
Ubuntu dispose d'une communauté de soutien beaucoup plus importante que Linux Mint. Cependant, la majorité de l'aide et des conseils d'Ubuntu s'applique également à Linux Mint. Ubuntu prend en charge plus de langues à partir du CD live, et est fourni avec une meilleure localisation. []