Junko Itō est un linguiste. Elle est née au Japon et travaille aux États-Unis.. Elle a obtenu son doctorat en linguistique en 1986 à l'université du Massachusetts Amherst. Son directeur de thèse était Alan Prince. Elle est professeur de linguistique à l'université de Californie, Santa Cruz. Elle a été directrice du département de 1999 à 2006.

Itō fait surtout des recherches sur la phonologie et la morphologie. Ses travaux sur la structure des syllabes sont bien connus. Elle a étudié et écrit sur le rendaku en langue japonaise. Ses travaux ont été publiés dans Linguistic Inquiry et dans d'autres revues de recherche en linguistique évaluées par des pairs. Elle travaille souvent avec un autre professeur de l'UCSC, son mari Armin Mester.

Elle est la fille du mathématicien Kiyoshi Itō.