La Floride est un État à la biodiversité diversifiée, avec 3 500 plantes vasculaires indigènes et 1 500 vertébrés, un nombre plus élevé que dans tous les autres États sauf trois. Une étude de l'Organisation des Nations unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO) de 2003 a indiqué que le détroit de Floride avait la plus grande biodiversité de l'océan Atlantique et abritait 25 espèces endémiques.
Flore
La marée rouge a également été un problème sur la côte sud-ouest de la Floride. Bien que l'on ait beaucoup spéculé sur la cause de la prolifération d'algues toxiques, rien ne prouve qu'elle soit due à la pollution ou qu'il y ait eu une augmentation de la durée ou de la fréquence des marées rouges.
Organismes nuisibles aux fleurs
La flore indigène est menacée par diverses plantes envahissantes, dont le poivron du Brésil (Schinus terebinthifolius). Il est illégal de posséder et de cultiver cet arbre. Un grand nombre de bénévoles abattent ces envahisseurs, en particulier le long des cours d'eau. Le pin d'Australie (Casuarina spp.) est activement attaqué.
Parmi les autres ravageurs étrangers, citons le scolyte asiatique de l'ambroisie (Xyleborus glabratus), qui menace l'industrie locale de l'avocat, et les arbres des baies rouges (Persea borbonia).
Il est illégal d'importer des escargots terrestres africains géants (achatina fulica). Ils menacent les bâtiments, 500 types de plantes locales et sont porteurs de méningite.
Faune
Les espèces endémiques de Floride comprennent le geai de Floride (Aphelocoma coerulescens), le bleu de Miami (Cyclargus thomasi bethunebakeri), le dard d'Okaloosa (Etheostoma okaloosae) et le cerf porte-clés (Odocoileus virginianus clavium).
La Floride est une destination populaire pour l'observation des oiseaux, en raison des nombreuses espèces que l'on peut trouver dans l'état à différentes périodes de l'année. La Société ornithologique de Floride tient à jour la liste officielle des oiseaux de Floride, qui contient actuellement 498 espèces. Une étude publiée en 2003 par la Florida Fish and Wildlife Conservation Commission a recensé 196 espèces d'oiseaux dont la reproduction a été confirmée dans l'État, et 19 autres espèces ont été répertoriées comme des reproducteurs possibles ou probables. Le Great Florida Birding Trail, un sentier de 3 200 km de long, est composé de 489 sites dans tout l'État qui sont d'excellents sites d'observation.
La pêche sportive est également populaire en Floride ; plus de 250 espèces de poissons différentes (dont 73 espèces non indigènes) peuvent être trouvées en Floride. Il y a plus de 1 000 espèces de poissons dans les eaux côtières de la Floride.
En 2010, la NOAA, citant la loi Magnuson-Stevens, a interdit la pêche du vivaneau rouge jusqu'à ce que la population ait le temps de se reconstituer.
La côte atlantique de la Floride abrite les seuls grands récifs coralliens du continent américain, et le troisième plus grand au monde. L'ensemble du système récifal des Florida Keys fait partie du Florida Keys National Marine Sanctuary, et de grandes parties du récif sont protégées dans le cadre du Biscayne National Park.
En 1977, le gouvernement fédéral a placé les alligators sur la liste des espèces menacées. Ils ont été retirés de la liste des espèces menacées en 1987 et la Floride a autorisé la chasse sélective en 1988.
Habitats des oiseaux et des tortues
En 1987, le comté de Brevard, en Floride, a accueilli le dernier membre du Moineau noir du bord de mer, aujourd'hui disparu. Il n'y a eu que deux espèces d'oiseaux éteintes depuis le début de l'inscription des espèces en danger en 1973. Cet événement a représenté un défi pour garantir que d'autres préoccupations environnementales soient rapidement prises en compte.
On pense depuis de nombreuses années que le geai de Floride est menacé, car l'espèce est territoriale et ne peut pas se déplacer vers de meilleures terres lorsque son habitat est en danger.
Les plages de nidification des tortues de mer caouannes sont protégées.
