L'isomérisme structurel (que l'UICPA appelle isomérisme constitutionnel) est une sorte d'isomérisme. Dans cet isomérisme, deux substances chimiques ont la même formule moléculaire, mais les molécules se sont liées dans des ordres différents. L'opposé de l'isomérie structurale est le stéréoisomérie. Il existe de nombreux mots qui représentent les isomères structuraux.

Il existe trois types d'isomères constitutionnels. Ce sont les isomères squelettiques, les isomères positionnels et les isomères fonctionnels. Les isomères positionnels sont également appelés régioisomères. Les tautomères sont également une sorte d'isomères fonctionnels.