Les veines bleues de Blue Stilton sont créées en perçant la croûte du fromage avec des aiguilles en acier inoxydable. Cela permet à l'air de pénétrer dans le cœur du fromage. Le fromage est ensuite affiné pendant neuf à douze semaines.
Pour que le fromage puisse porter le nom de "Stilton", il doit être fabriqué dans l'un des trois comtés du Derbyshire, du Leicestershire et du Nottinghamshire, et doit utiliser du lait local pasteurisé. Les fabricants de fromage Stilton de ces comtés ont demandé et obtenu une protection au titre du droit européen (AOP = appellation d'origine protégée) en 1996.
Le Stichelton est fabriqué de la même manière que le fromage Stilton et utilise du lait de vache provenant du Nottinghamshire, mais le lait n'est pas pasteurisé et ne peut donc pas être désigné comme du vrai Stilton sous l'AOP.
En septembre 2016 [mise à jour], seules six laiteries sont autorisées à fabriquer du Stilton (trois dans le Leicestershire, deux dans le Nottinghamshire et une dans le Derbyshire). Chaque laiterie est contrôlée par un organisme de contrôle indépendant accrédité selon la norme européenne EN 45011. Quatre des laiteries agréées sont basées dans la Vale of Belvoir, qui est à cheval sur la frontière entre le Nottinghamshire et le Leicestershire. Cette région est considérée comme le cœur de la production de Stilton. Les laiteries sont situées dans la ville de Melton Mowbray et dans les villages de Colston Bassett, Cropwell Bishop, Long Clawson et Saxelbye.
Une autre laiterie du Leicestershire était située sur le terrain de Quenby Hall, près du village de Hungarton. Il y avait une laiterie à cet endroit au 18e siècle. Quenby Hall a relancé la production de Stilton dans une nouvelle laiterie en août 2005, mais l'entreprise a fermé en 2011.
L'ancienne laiterie sous licence appartenant à Dairy Crest- qui produisait du Stilton à Hartington dans le Derbyshire a été rachetée par la laiterie de Long Clawson en 2008 et a fermé en 2009, la production étant transférée dans le Leicestershire. Deux anciens employés ont créé la crémerie de Hartington à Pikehall dans la paroisse de Hartington, qui a obtenu une licence en 2014.
Le fromage Stilton ne peut pas être produit dans le village qui lui a donné son nom. Le village de Stilton ne se trouve pas dans les trois comtés autorisés ; il se trouve dans le comté historique de Huntingdonshire dans le Cambridgeshire. L'Original Cheese Company a demandé au Defra de modifier l'AOP de Stilton pour y inclure le village, mais la demande a été rejetée en 2013.
Le fromage Stilton était également fabriqué dans le Staffordshire. La famille Nuttall de Beeby, dans le Leicestershire, a ouvert une fromagerie de Stilton à Uttoxeter en 1892 pour profiter du lait local et des bonnes liaisons de transport.