1884–1989
Le club a été fondé en 1884 à la suite d'une rupture avec une équipe locale appelée Heather Rangers. En 1890, les Warriors se sont installés à Ochilview Park après avoir fait des séjours à Tryst Park et à Goschen Park. Au début du XXe siècle, le club a connu une brève période de succès, remportant la Coupe de qualification écossaise à deux reprises en 1901 et 1902. En 1902-03, le club atteint la demi-finale de la Coupe d'Écosse, s'inclinant 1-4 à domicile face aux Rangers. La saison 1921-22 a vu Stenhousemuir participer pour la première fois à une compétition de football senior de la Ligue écossaise.
En 1925-26, le gardien de but de Stenhousemuir, Joe Shortt, s'est vu offrir un pot-de-vin de 50 £ pour organiser un match contre Broxburn, mais il a rejeté l'offre et les Warriors ont remporté le match 6-2. Un bookmaker de Bainsford, un petit village à la périphérie de Falkirk, a ensuite été emprisonné pour tentative de truquage de match. []
En 1928, la tribune en bois du parc Ochilview a brûlé dans un incendie, ce qui a conduit à la construction d'une nouvelle tribune à sa place, bien que des escaliers aient dû être ajoutés plus tard en raison d'erreurs de planification. Au cours de la saison 1936-37, le club enregistre une victoire record - une victoire 9-2 contre Dundee United. Plus d'une décennie plus tard, en 1949-50, un quart de finale de la Coupe d'Écosse contre East Fife a attiré une foule record de 12 500 personnes - le nombre le plus élevé jamais enregistré à Ochilview Park. []. En novembre 1951, le premier match éclairé entre deux équipes seniors écossaises a eu lieu à Ochilview Park, entre Stenhousemuir et Hibernian. []
Au cours de l'été 1964, le Rangers FC a révélé à la Scottish Football League un plan visant à retirer les Warriors de la ligue, ainsi que quatre autres clubs, au motif qu'ils étaient des clubs soutenus par les plus pauvres au cours des trois saisons précédentes. Quatre ans plus tard, Stenhousemuir, ainsi que les Albion Rovers, les Berwick Rangers, Brechin City et Stranraer, avec le soutien d'un certain nombre de clubs, dont le Celtic F.C., le Hamilton Academical F.C. et les Airdrieonians F.C., ont réussi à faire échouer ce plan.
En 1972-73, les Warriors ont battu les Rangers 2-1 au stade d'Ibrox lors de la Coupe de la Ligue écossaise. Les Rangers étaient notamment les détenteurs de la Coupe des vainqueurs de coupe de l'UEFA à l'époque. []
De 1990 à aujourd'hui
En 1992-93, l'équipe a permis à son rival Stirling Albion de partager son stade Ochilview Park. Au cours de la saison 1993-94, les Warriors ont quitté pour la première fois la ligue inférieure, en raison de la formation de la troisième division écossaise. Le milieu des années 90 a été l'une des périodes les plus réussies de l'histoire du club ; en 1994-95, ils ont battu St. Johnstone 4-0 et Aberdeen 2-0, deux équipes de ligue supérieure, en route vers les quarts de finale de la Coupe d'Écosse. Au cours de la saison 1995-96, Stenhousemuir a remporté la Scottish Challenge Cup, en battant Dundee United 5-4 aux tirs au but après 90 minutes sans but et une prolongation. Ce faisant, ils ont atteint leur première demi-finale nationale depuis 1902.
Stenhousemuir a été relégué de la deuxième division écossaise à la troisième division écossaise pour la première fois dans l'histoire du club. [] Cependant, la saison suivante, il a été promu en deuxième division, une première dans l'histoire du club.
En 2006-2007, le club a annoncé un plan visant à poser de la "fausse" pelouse au parc Ochilview. Il est devenu le premier au Royaume-Uni à obtenir l'accréditation de la catégorie 2 étoiles de la FIFA.
Stenhousemuir a été promu en deuxième division écossaise après avoir battu Cowdenbeath 5-4 aux tirs au but après un match nul 0-0 sur l'ensemble des deux matches en finale des play-offs à la fin de la saison 2008-09. La saison 2010-11 a vu le club éviter de justesse la relégation après avoir passé la majeure partie de la saison dans la zone de relégation. Lors de la dernière journée de la saison, le club a battu Peterhead 3-0 pour passer au-dessus d'Alloa Athletic et a donc évité les barrages de relégation.
Pour la saison 2011/2012, le Home Kit est sponsorisé par Figure 11 Communications Ltd, le Away Kit est sponsorisé par Apex Hotels, et l'arrière du kit est sponsorisé par Wright & MacLennan.