La spéciation concerne la façon dont les espèces se forment. C'est une partie importante de la biologie de l'évolution.

Darwin pensait que la plupart des espèces étaient directement issues d'espèces préexistantes. C'est ce qu'on appelle l'anagénèse : les espèces changent, ou "évolution phylétique". Pendant une grande partie du XXe siècle, nous pensions que la plupart des espèces étaient issues d'une division précédente des espèces : la cladogenèse. L'opinion générale était que la plupart des scissions d'espèces sont causées ou favorisées par des mécanismes d'isolement.

La séparation physique des espèces qui ont vécu ensemble est sans aucun doute un facteur essentiel. Elle est illustrée par de nombreux exemples, dont certains sont examinés ci-dessous.

Cependant, les travaux des 20 dernières années ont mis en évidence d'autres causes. L'analyse de la séquence d'ADN des êtres vivants a montré qu'il y a souvent une certaine hybridation entre des espèces apparentées. Cela signifie que des gènes ont été transférés par ces croisements. Cela signifie que l'isolement reproductif n'est pas la seule définition d'une espèce, et que la spéciation ne nécessite pas toujours l'allopatrie (espèces à séparer sur le plan reproductif). Les sections ci-dessous illustrent l'idée que la séparation physique était de première importance dans la formation de nouvelles espèces.