Le nom des souverains de la deuxième dynastie n'est pas connu avec exactitude. La plupart des sources s'accordent sur les noms des premiers pharaons. Ceux-ci sont :
| Nom | Années de règne |
| Hotepsekhemwy | 38 |
| Nebra (peut-être identifiable avec Weneg) | 10–14 |
| Nynetjer | 40 |
| Senedj (peut-être identifiable avec Horus Sa) | 20 |
Le nom des deux ou trois prochains dirigeants n'est pas clair. Il se peut que ces dirigeants portent à la fois le nom d'Horus ou de Nebty (deux femmes) et leur nom de naissance, mais il peut s'agir d'individus entièrement différents ou de noms légendaires. À gauche, on trouve les souverains que la plupart des égyptologues placent ici ; à droite, les noms de l'Aegyptica de Manéthon :
| Proposition de règle | La liste de Manetho |
| Seth-Peribsen | Kaires |
| Nepherkheres |
| Sekhemib-Perenmaat | Sesokhris |
Avec la dernière règle, nous revenons à un accord :
| Nom | Années de règne |
| Khasekhemwy | 17–18 |
Manetho a écrit que la capitale était à Thinis, la même qu'à la Première Dynastie. Cependant, au moins les trois premiers rois ont été enterrés à Saqqara. Cela pourrait signifier que le centre du pouvoir s'était déplacé à Memphis. Au-delà de cela, on ne peut pas dire grand-chose sur les événements de cette période. Les registres annuels de la pierre de Palerme ne subsistent que pour la fin du règne de Nebra et pour certaines parties de celui de Nynetjer. Un événement important s'est peut-être produit sous le règne de Khasekhemwy : de nombreux égyptologues ont lu son nom ("les deux puissances se lèvent") comme commémorant l'union de la Haute et de la Basse-Égypte.
