La théorie de la pompe à Sahara tente d'expliquer comment les plantes et les animaux d'Afrique se sont déplacés vers le Moyen-Orient, puis vers l'Europe et l'Asie.

À l'époque, l'Afrique était plus pluvieuse qu'aujourd'hui, et le Sahara était plus humide, avec des lacs plus grands et des rivières plus nombreuses.

Les périodes pluvieuses africaines sont associées à une phase de "Sahara humide", durant laquelle il existe des lacs plus grands et des rivières plus nombreuses. Cela entraîne des changements dans le type d'animaux présents dans la région.

Indépendamment de l'aridité du grand Sahara, la migration le long du corridor fluvial a été interrompue lorsque, lors d'une phase de désert il y a 1,8-0,8 millions d'années, le Nil a cessé de couler complètement et n'a peut-être coulé que temporairement à d'autres périodes en raison du soulèvement de la houle nubienne.

Pendant les périodes de Sahara humide, le Sahara et l'Arabie deviennent une prairie de savane et la flore et la faune africaines deviennent communes. Au cours de la période sèche suivante, le Sahara redevient un désert, généralement en raison du recul de la mousson d'Afrique de l'Ouest vers le sud. L'évaporation dépasse les précipitations, le niveau de l'eau des lacs comme le lac Tchad baisse et les rivières deviennent des oueds asséchés.

La flore et la faune, auparavant très répandues, se retirent vers le nord dans les montagnes de l'Atlas, vers le sud en Afrique de l'Ouest, ou vers l'est dans la vallée du Nil et de là, soit vers le sud-est dans les hauts plateaux éthiopiens et au Kenya, soit vers le nord-est à travers le Sinaï en Asie. Cela sépare les populations de certaines des espèces dans des zones au climat différent, les obligeant à s'adapter, ce qui peut donner lieu à une spéciation (scission des espèces).

La pompe saharienne a été utilisée pour dater quatre vagues d'émigration humaine en provenance d'Afrique, à savoir :