En biologie moderne, un protoplaste est ce qui reste d'une cellule lorsque la paroi cellulaire est dissoute. Il reste donc le noyau de la cellule et les matériaux protoplasmiques environnants.

Définition : un protoplaste est une cellule végétale, bactérienne ou fongique dont la paroi cellulaire a été totalement ou partiellement enlevée par des moyens mécaniques ou enzymatiques.

Comme les parois cellulaires sont fabriquées différemment dans les différents royaumes, différentes enzymes sont utilisées pour les éliminer.