Le phénotype d'un organisme est l'ensemble des caractères (ou traits) de cet organisme.
Cela ne signifie pas seulement "ce que vous pouvez voir à la surface". Il s'agit plutôt de tout ce qui peut être rendu visible par des moyens appropriés. Par exemple, les groupes sanguins font définitivement partie du phénotype. Cependant, ils ne sont pas visibles simplement en regardant une personne.
En biologie, on distingue le phénotype du génotype. C'est ce qu'a proposé Wilhelm Johannsen en 1911 pour faire la différence entre l'hérédité d'un organisme et ce que cette hérédité produit. La distinction est similaire à celle proposée par August Weismann, qui distinguait entre le plasma germinatif (les gamètes ou leurs cellules souches) et les cellules somatiques (le corps).
Le phénotype est important car il est exposé à la sélection naturelle :
Les phénotypes sont principalement déterminés par les gènes et sont influencés par des facteurs environnementaux. Ainsi, connaître le génome d'un organisme ne permet pas de prédire exactement son phénotype.
Les caractéristiques varient grandement en fonction de ce qu'elles doivent à l'hérédité (nature vs éducation). L'interaction entre le génotype et le phénotype a souvent été conceptualisée par la relation suivante :

