L'Université nationale de San Marcos (en espagnol : Universidad Nacional Mayor de San Marcos, UNMSM) est une université publique située à Lima, au Pérou. Elle a été fondée le 12 mai 1551. C'est la première et la plus importante université du Pérou et la plus ancienne université des Amériques. L'Université de San Marcos compte 20 facultés et 62 écoles universitaires. Elle compte 28 645 étudiants de premier cycle et 3 447 étudiants de deuxième cycle. L'université nationale de San Marcos compte de nombreux étudiants et diplômés de renom, dont le seul prix Nobel péruvien, Mario Vargas Llosa. Sur le plan académique, l'université de San Marcos est la première du Pérou.