La myco-hétérotrophie est une relation entre certaines plantes et certains champignons. La plante tire tout ou partie de sa nourriture du parasitisme des champignons, et non de la photosynthèse.

Dans le passé, on pensait que les plantes non photosynthétiques se nourrissaient en décomposant la matière organique comme le font les champignons. Ces plantes étaient donc appelées "saprophytes". C'était une erreur. On sait maintenant qu'aucune plante n'est physiologiquement capable de décomposer directement la matière organique.

Pour se nourrir, les plantes non photosynthétiques se livrent à un parasitisme, par myco-hétérotrophie ou parasitisme direct d'autres plantes.

Dans cette association, l'interface entre la plante et les partenaires fongiques se situe entre les racines de la plante et le mycélium du champignon. La myco-hétérotrophie ressemble donc beaucoup à la mycorhize, et on pense qu'elle a évolué à partir de celle-ci.