La micropaléontologie (parfois aussi appelée micropaléontologie) est la branche de la paléontologie qui étudie les microfossiles. Les microfossiles sont des fossiles qui ne dépassent généralement pas quatre millimètres, et qui sont généralement plus petits qu'un millimètre. Un microscope est utilisé pour les étudier. Chaque règne d'organismes est représenté dans l'enregistrement des microfossiles. Les microfossiles peuvent fournir des informations importantes sur l'écologie du passé.
Les personnes qui étudient la micropaléontologie sont appelées micropaléontologues. La taxonomie et les statistiques sont des éléments importants de la micropaléontologie.
Les microfossiles sont plus courants dans les sédiments qui se forment sous l'eau, en particulier dans l'eau des océans ou des lacs. De très vieux microfossiles peuvent être trouvés dans la roche. Des techniques spéciales sont utilisées pour séparer les microfossiles de la roche. Par exemple, les coquilles des diatomées et de certains autres organismes sont faites de silice ; d'autres matériaux présents dans la roche peuvent parfois être éliminés à l'aide d'acide, ne laissant que les coquilles de silice.
La micropaléontologie peut être divisée en quatre domaines d'étude. Les différents domaines d'étude utilisent des techniques différentes pour séparer les microfossiles. En effet, les microfossiles sont constitués de différents minéraux :
Le domaine d'étude du pollen et des spores, y compris les fossiles, est appelé palynologie.


