Le 19 janvier 2012, le ministère de la justice des États-Unis a saisi et fermé le site d'hébergement de fichiers Megaupload.com et a engagé des poursuites pénales contre ses propriétaires et d'autres personnes. Dans le monde entier, le Federal Bureau of Investigation a arrêté Kim Schmitz (fondateur), Finn Batato (CMO), Mathias Ortmann (CTO et co-fondateur), et Bram van der Kolk a été arrêté par l'Organised and Financial Crime Agency of New Zealand. Leur demande de mise en liberté sous caution a été rejetée par un tribunal néo-zélandais, les autorités américaines s'y opposant dans cette affaire. Le 20 janvier, les douanes de Hong Kong ont gelé plus de 300 millions de dollars HK (39 millions de dollars US) d'actifs appartenant à la société.
L'affaire a particulièrement attiré l'attention du public car les arrestations ont eu lieu au lendemain d'une grande manifestation contre la proposition de législation visant à étendre l'autorité juridique des États-Unis contre les sites web de piratage étrangers. Peu de temps après, le site web du ministère de la justice et les sites web d'un certain nombre d'autres organisations ont été mis hors ligne à la suite d'attaques concertées de déni de service de la part du groupe militant Anonymous.
Un porte-parole du groupe a décrit les attaques comme "la plus grande attaque Internet de l'histoire [du groupe]" dans une interview, ajoutant que c'était "un cas terrible de hasard que des agents fédéraux se soient attaqués à Megaupload quelques heures seulement après la remise en ligne des milliers de sites protestant contre le black-out de la SOPA". Les internautes étaient de loin prêts à défendre un Internet ouvert... les fédéraux "n'auraient pas pu choisir un pire moment pour mettre fin à Megaupload". Il a noté que du début jusqu'au moment où les serveurs web du gouvernement étaient hors ligne, il ne s'est écoulé que 70 minutes.
Outre le site justice.gov du ministère de la justice, l'attaque par déni de service a concerné Universal Music Group, Recording Industry Association of America (RIAA), Motion Picture Association of America (MPAA), Broadcast Music, Inc. (BMI), et le site web du Federal Bureau of Investigation. "Même si la SOPA n'a pas encore été adoptée, le gouvernement fédéral a toujours eu un pouvoir énorme pour faire certaines des choses qu'il veut faire. Donc, si c'est ce qui peut se produire sans que la SOPA soit adoptée, imaginez ce qui peut se produire après l'adoption de la SOPA", a déclaré M. Brown à la RT. Les Anonymous ont également attaqué le site web de l'organisation anti-piratage française.
Le 19 janvier 2012, les Anonymous ont publié une déclaration sur Pastebin.com acceptant la responsabilité des attaques de masse sur les sites web, notamment ceux de la RIAA, de la MPAA, du BMI, du FBI et d'autres.