Le fumier est utilisé depuis des siècles comme engrais pour l'agriculture, car il est riche en azote et autres nutriments qui facilitent la croissance des plantes. Le lisier des exploitations porcines est généralement coupé (injecté) directement dans le sol pour réduire les odeurs désagréables. Le fumier des porcs et du bétail est épandu sur les champs à l'aide d'un épandeur à fumier. En raison de la teneur relativement faible en protéines des herbes, dont se nourrissent les herbivores, le fumier de bovins a une odeur plus douce que la bouse des carnivores - par exemple, la bouse d'éléphant est pratiquement inodore. Cependant, en raison de la quantité de fumier épandu dans les champs, les odeurs peuvent poser un problème dans certaines régions agricoles. Les fientes de volaille sont nocives pour les plantes lorsqu'elles sont fraîches, mais après une période de compostage, elles constituent un engrais précieux.
Le fumier séché des animaux a été utilisé comme combustible tout au long de l'histoire. Le fumier séché (généralement connu sous le nom de bouse) des vaches était, et est toujours, une source importante de combustible dans des pays comme l'Inde, tandis que la bouse de chameau peut être utilisée dans des régions sans arbres comme les déserts. Sur la piste de l'Oregon, les familles de pionniers ramassaient de grandes quantités de "copeaux de buffle" en lieu et place du bois de chauffage rare. Il a été utilisé à de nombreuses fins, pour faire des feux de cuisine et pour combattre les nuits froides du désert.
Une autre utilisation du fumier est la fabrication de papier. Cela a été fait avec les excréments d'éléphants, où il s'agit d'une petite industrie en Afrique et en Asie, ainsi qu'avec des chevaux, des lamas et des kangourous. À l'exception des lamas, ces animaux ne sont pas des ruminants et ont donc tendance à passer des fibres végétales non digérées dans leurs excréments.
