Origines
Le synode du Missouri a été lancé par plusieurs communautés de luthériens allemands aux États-Unis. F. C. D. Wyneken a effectué un travail de mission dans l'Indiana, l'Ohio et le Michigan. Martin Stephan a créé une communauté de luthériens dans le comté de Perry, Missouri, et à St. Louis, Missouri. Wilhelm Löhe envoie des missionnaires dans le Michigan et l'Ohio.
L'immigration saxonne
Au XIXe siècle, dans le royaume de Saxe, le pasteur luthérien Martin Stephan et nombre de ses disciples pensaient que leur église serait obligée de fusionner avec l'église réformée. Pour cette raison, Stephan et entre 600 et 700 autres luthériens de Saxe ont quitté l'Allemagne pour s'installer aux États-Unis en novembre 1838. Ils disposaient de cinq navires.
Leurs navires sont arrivés entre le 31 décembre 1838 et le 20 janvier 1839 à la Nouvelle-Orléans. Un navire a été perdu en mer. Par la suite, ils se sont installés dans le comté de Perry, dans le Missouri. Au début, Stephan était l'évêque. Plus tard, d'autres membres ont déclaré que Stephan était corrompu et fornicateur, et il a donc été mis à la porte. C'est ainsi que C. F. W. Walther devint le nouveau chef.
Les missionnaires de Löhe
En 1842, un pasteur allemand nommé Wilhelm Löhe a commencé à envoyer des missionnaires en Amérique. Ils ont fondé des congrégations dans l'Ohio, le Michigan et l'Indiana.
Fondation et premières années
En 1844 et 1845, les trois groupes mentionnés ci-dessus (les Saxons, les missionnaires de Löhe et Wyneken) ont commencé à parler de la possibilité de commencer un synode. Le 26 avril 1847, douze pasteurs se sont réunis à Chicago, dans l'Illinois, et ont officiellement lancé le synode évangélique luthérien allemand du Missouri, de l'Ohio et d'autres États. Walther en fut le premier président.
Le synode a été conservateur. Löhe est parti parce qu'il était en désaccord avec une partie de sa doctrine.
La Conférence synodale
En 1857 et 1872, le LCMS est entré en communion avec cinq autres synodes luthériens conservateurs. Ces groupes ont formé la Conférence synodale évangélique luthérienne d'Amérique du Nord.
Transition vers l'anglais
Pendant les trente années qui ont suivi son lancement, le synode du Missouri s'est concentré sur les luthériens germanophones. En 1872, les membres du synode du Missouri, ainsi que trois autres synodes, ont créé la "English Evangelical Lutheran Conference of Missouri". Ce groupe s'est concentré sur les anglophones. Il est devenu un synode indépendant en 1888 et a fusionné avec la LCMS en 1911.
L'anglais est devenu plus courant dans le LCMS au cours des deux premières décennies du XXe siècle. Certains ont abandonné tous les services allemands.
Après la Seconde Guerre mondiale
En 1947, le synode a abrégé son nom en "Synode de l'Église luthérienne et du Missouri". En 1964, l'Église nationale évangélique luthérienne, une Église luthérienne historiquement finno-américaine, a fusionné avec le LCMS. En 1971, le Synode des Églises évangéliques luthériennes, une église historiquement slovaque-américaine, a fusionné avec le LCMS.
La Conférence synodale s'est interrompue en 1963. Six ans plus tard, le LCMS a formé le Conseil luthérien des États-Unis d'Amérique (LCUSA) avec plusieurs autres synodes luthériens. Ceux-ci étaient modérés et libéraux. Par la suite, le LCMS a recommencé à devenir plus conservateur.
Certains des professeurs et des étudiants les plus libéraux ont quitté le séminaire de Concordia et ont créé Seminex. En 1976, environ 250 des congrégations les plus libérales ont quitté le Synode. Puis le LCMS a quitté la LCUSA.