Microbiote de l'organisme humain

Le microbiome humain (ou microbiote humain) est la collection de micro-organismes qui vivent sur nous. Ils vivent sur la peau, dans la salive et la bouche, dans les yeux, dans l'intestin et le reste du tube digestif. Ils comprennent les bactéries, les archées, les champignons et les eucaryotes unicellulaires ("protozoaires"). Tout le monde transporte beaucoup plus de ces microbes que le nombre de cellules humaines dans le corps. Le corps humain compte environ 100 billions de cellules et transporte environ dix fois plus de microorganismes rien que dans les intestins.

Le microbiome est "la communauté écologique de microorganismes commensales, symbiotiques et pathogènes qui partagent littéralement notre espace corporel". Le terme a été inventé à l'origine par Joshua Lederberg. Il pensait que les microorganismes vivant dans le corps humain en bonne santé et dans la maladie étaient importants. De nombreux articles scientifiques distinguent "microbiome" et "microbiote" pour décrire respectivement les génomes collectifs des microorganismes qui vivent dans une niche environnementale ou les microorganismes eux-mêmes. Cependant, selon les définitions originales, ces termes sont largement synonymes.

Certains de ces organismes sont utiles pour l'homme. Cependant, la plupart n'ont aucun effet connu. Ce ne sont que des symbiotes : ils vivent avec nous. Ceux qui sont censés être présents sont des membres de la flore normale. Dans des circonstances normales, ils ne provoquent pas de maladies, mais peuvent même aider notre santé. En 2009, des études ont demandé si la réduction de ce biote nuisait à notre santé. C'est certainement le cas de la flore intestinale.

Bien que le terme "flore" fasse référence aux plantes plutôt qu'aux bactéries, le terme "flore intestinale" est largement utilisé et familier aux biologistes. Le terme "biote" désigne l'ensemble des organismes présents dans un écosystème. Le terme "microbiote" convient mieux aux bactéries et autres microorganismes, mais il ne fait aucun doute que le terme "flore" est souvent utilisé.

Les microbes dont il est question sont généralement non pathogènes (ils ne provoquent pas de maladie à moins qu'ils ne se développent anormalement) ; ils existent en harmonie et en symbiose avec leurs hôtes.

Les chercheurs ont appris qu'une grande partie des microbes présents dans le corps humain ne sont pas des bactéries mais une très ancienne classe d'organismes unicellulaires appelés archaebactéries. Ils comprennent des méthanogènes qui produisent du méthane et peuvent provoquer des flatulences.

Colonies de Yersinia enterocolitica sur des plaques de gélose XLDZoom
Colonies de Yersinia enterocolitica sur des plaques de gélose XLD

Staphylococcus aureus , grossissement x50 000, image au microscope électronique à transmissionZoom
Staphylococcus aureus , grossissement x50 000, image au microscope électronique à transmission

Escherichia coli : un résident de longue durée dans notre intestinZoom
Escherichia coli : un résident de longue durée dans notre intestin

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Questions et réponses

Q : Qu'est-ce que le microbiome humain ?


R : Le microbiome humain (ou microbiote humain) est l'ensemble des micro-organismes qui vivent sur nous, tels que les bactéries, les archées, les champignons et les eucaryotes unicellulaires.

Q : Combien de cellules le corps humain possède-t-il ?


R : Le corps humain compte environ 100 trillions de cellules.

Q : Qu'a inventé Joshua Lederberg ?


R : Joshua Lederberg a inventé le terme "microbiome".

Q : Quelle est la différence entre "microbiome" et "microbiote" ?


R : D'une manière générale, le "microbiome" fait référence aux génomes collectifs des micro-organismes qui vivent dans une niche environnementale tandis que le "microbiote" fait référence aux micro-organismes eux-mêmes.

Q : Tous les microbes sont-ils utiles à l'homme ?


R : Non, la plupart des microbes n'ont aucun effet connu et ne sont que des symbiotes vivant avec nous. Ceux qui sont censés être présents sont des membres de la flore normale et ne provoquent pas de maladie, sauf s'ils se développent anormalement.

Q : Qu'est-ce que la flore intestinale ?


R : La flore intestinale désigne une population de microbes que l'on trouve dans l'intestin ou les intestins humains. Elle peut comprendre des bactéries, des archées, des champignons et d'autres organismes unicellulaires.

Q : Que sont les méthanogènes ?


R : Les méthanogènes sont un type d'archées qui produisent du gaz méthane et peuvent provoquer des flatulences.

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