Les gènes Hox sont un groupe de gènes apparentés qui déterminent la structure de base et l'orientation des animaux. Hox" est l'abréviation de "homeobox".

Les gènes Hox sont essentiels pour le bon positionnement des structures des segments des animaux au cours du développement embryonnaire précoce (par exemple, les pattes, les antennes et les ailes chez les mouches à fruits ou les différentes côtes des vertébrés chez l'homme).

Les gènes Hox sont un complexe de gènes dont les protéines se lient aux régions régulatrices des gènes cibles. Les gènes cibles activent ou répriment alors les processus cellulaires pour diriger le développement final de l'organisme.