Microbiote intestinal humain

La flore intestinale est constituée de microorganismes qui vivent dans le système digestif des animaux. C'est le plus grand réservoir de microbes dans le microbiome humain.

Le corps humain, composé d'environ 100 billions de cellules, transporte environ dix fois plus de micro-organismes dans les intestins. Les activités métaboliques exercées par ces bactéries ressemblent à celles d'un organe, ce qui a conduit certains à qualifier la flore intestinale d'"organe oublié". On estime que cette flore intestinale possède environ 100 fois plus de gènes au total que le génome humain.

Les bactéries constituent la majeure partie de la flore du côlon et jusqu'à 60 % de la masse sèche des fèces. Quelque 300 à 1000 espèces différentes vivent dans l'intestin, la plupart des estimations étant d'environ 500. Cependant, il est probable que 99% des bactéries proviennent de 30 ou 40 espèces. Les champignons et les protozoaires font également partie de la flore intestinale, mais on sait peu de choses sur leurs activités.

Les recherches suggèrent que la relation entre la flore intestinale et l'homme n'est pas simplement commensale (une coexistence non nuisible), mais plutôt symbiotique. Bien que l'homme puisse survivre sans la flore intestinale, les micro-organismes remplissent une foule de fonctions utiles, comme la fermentation de substrats énergétiques inutilisés, la formation du système immunitaire, la prévention de la croissance de bactéries pathogènes et nocives, la régulation du développement de l'intestin, la production de vitamines pour l'hôte (comme la biotine et la vitamine K) et la production d'hormones pour diriger l'hôte vers le stockage des graisses. Toutefois, dans certaines conditions, certaines espèces peuvent provoquer des maladies en produisant une infection ou en augmentant le risque de cancer pour l'hôte.

Des composés alimentaires tels que les polyphénols, les oligosaccharides et les polysaccharides peuvent être utiles pour les bonnes bactéries et aider à réduire les espèces pathogènes de la flore intestinale humaine.

Plus de 99 % des bactéries dans l'intestin sont anaérobies, mais dans le caecum, les bactéries aérobies atteignent des densités élevées.

Le point de vue traditionnel est qu'aucun phylum métazoïque ne peut décomposer la cellulose en produisant l'enzyme cellulase. Au contraire, les herbivores contiennent, dans leur intestin, des micro-organismes qui produisent de la cellulase. Ceci est important car la cellulose est le composé organique le plus courant sur Terre. Environ 33 % de toute la matière végétale est de la cellulose (la teneur en cellulose du coton est de 90 % et celle du bois de 40 à 50 %). Récemment, il est apparu que certains animaux produisent leur propre cellulase. La question n'est pas encore tout à fait réglée.

Escherichia coli , une des nombreuses espèces de bactéries présentes dans l'intestin humain
Escherichia coli , une des nombreuses espèces de bactéries présentes dans l'intestin humain

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