À la veille du déclenchement de la Seconde Guerre mondiale, le sentiment anticolonial bouillonnait dans toute l'Asie du Sud-Est. Pendant la guerre, l'armée impériale japonaise a balayé la région à vive allure. Si certains habitants de la région ont pu être optimistes au départ quant à l'éviction des impérialistes européens, les Japonais se sont révélés être des dirigeants brutaux ; des millions d'entre eux ont été enrôlés dans des travaux forcés. Dans une tentative de gagner la coopération locale, les Japonais ont attisé le ressentiment de l'Occident ; comme conséquence involontaire, à la fin de la guerre, lorsque les Japonais se sont retirés et que les Européens sont revenus, le sentiment nationaliste était non seulement élevé, mais aussi organisé.
Une à une, les anciennes colonies ont gagné ou obtenu leur indépendance, mais elles ont dû faire face à de nouveaux défis : les émeutiers civils, les insurgés minoritaires et les guérillas communistes - agissant souvent à l'instigation des puissances de la guerre froide, de la Chine, de l'Union soviétique et des États-Unis - ont souvent sapé la stabilité.
Le Vietnam, après sa libération des Français, a d'abord été divisé en deux, le nord allant au leader de la résistance et au marxiste Ho Chi Minh et le sud à l'anticommuniste Ngo Dinh Diem. Les États-Unis craignaient un Vietnam communiste et sont intervenus - d'abord subrepticement, puis dans une guerre totale - pour contrecarrer les efforts du Nord visant à unifier le pays sous le régime communiste. Le Nord a gagné, mais seulement après des pertes catastrophiques des deux côtés.
Pendant ce temps, une guerre de l'ombre se déroulait au Cambodge et au Laos, les bombardiers américains tentant de déloger les guérillas communistes vietnamiennes en passant par les pays voisins du Vietnam. Le Cambodge se dissout dans une guerre civile et les Khmers rouges prennent le pouvoir. Le nouveau régime, sous Pol Pot, aspirait à une société communiste agraire, ethniquement khmère. Une grande partie de la population - environ 1,5 million de Cambodgiens (20 % de la population) - a été tuée lors de purges avant que les forces vietnamiennes ne mettent fin au cruel et terrifiant règne de quatre ans des Khmers rouges en 1979.
Les purges anticommunistes en Indonésie dans les années 1960 ont fait des centaines de milliers de morts et ont abouti à la dictature de Suharto, qui a duré trois décennies. Un coup d'État en 1962 a inauguré un demi-siècle de régime militaire pratiquement ininterrompu au Myanmar. La Thaïlande a connu une douzaine de coups d'État militaires depuis 1932. La Malaisie et surtout Singapour sont saluées comme les succès de l'après-guerre dans la région, bien que l'ordre ait souvent été maintenu aux dépens des libertés civiles, par le biais de lois anti-sédition et de restrictions de la liberté de la presse.