Le retour de Cope à Philadelphie a eu lieu avant la fin de la guerre civile. Il a épousé une fille quaker qu'il connaissait, Annie Pim. Elle vivait dans une ferme et le mariage a eu lieu chez elle.
Cope a écrit des articles sur les poissons, les baleines, et un autre sur une grenouille fossile avec une queue. p835 Le père de Cope a donné de l'argent à un petit collège quaker appelé Haverford College. Le collège a donné à Cope une maîtrise honorifique et l'a engagé pour enseigner la zoologie. p48
Cope a effectué des voyages scientifiques dans l'Ouest américain et a écrit des lettres à ses parents, à sa femme et à sa fille pendant ces voyages. Il a dit à son père que l'enseignement prenait trop de son temps pour qu'il puisse faire des découvertes scientifiques. p143/6 Il a quitté son travail au collège. Il s'installe alors avec sa femme et sa fille à Haddonfield pour se rapprocher des gisements de fossiles de l'ouest du New Jersey.
À Haddonfield, dans le New Jersey, se trouvaient des marlpits, où un squelette de dinosaure a été découvert en 1858 par William Foulke et nommé Hadrosaurus foulkii par le Dr Leidy de l'Académie des sciences naturelles de Philadelphie. p151/8 Cope y a trouvé d'autres fossiles dans les marlpits. Par exemple, il a décrit Elasmosaurus platyurus et Laelaps en 1868. Edward Cope a également participé à des expéditions dans des grottes ; la dernière grotte qu'il a visitée était la Wyandotte Caves dans l'Indiana en 1871.p151/5
Dans la trentaine, le quaker a écrit de nombreux articles scientifiques qui ont été publiés. Charles Sternberg disait que dans les champs de fossiles de Kansas Cope, il y avait une "grave attaque de cauchemar ... chaque animal dont nous avions trouvé trace pendant la journée jouait avec lui la nuit ... parfois il perdait la moitié de la nuit dans ce sommeil épuisant". p167
Cope a également cherché des fossiles dans l'ouest des États-Unis. En 1872, il a exploré les roches de l'Éocène. Ces roches avaient entre 55 et 38 millions d'années. Cette année-là, il a trop travaillé et a eu une panne. p583 En 1873, il a étudié les lits (strates) de Titanothere du nord-est du Colorado. Titanothere était un grand herbivore éteint. p183/194
L'enquête Wheeler
En 1874, Cope se porte volontaire pour l'enquête Wheeler. Ces voyages de cartographie géologique étaient dirigés par George Montague Wheeler. Ils ont cartographié les régions des États-Unis à l'ouest du 100e méridien. p200 Le 100e méridien ouest est la frontière entre l'Ouest sec et l'Est pluvieux des États-Unis.
En 1874, Cope a découvert la formation de Puerco au Nouveau-Mexique lors du Wheeler Survey. p200 La formation de Puerco était une couche de roche tendre de 500 pieds d'épaisseur le long de la partie supérieure du fleuve Puerco, près de Cuba, au Nouveau-Mexique. C'était de la marne verte et noire (qui contenait des produits chimiques utilisés dans la fabrication d'engrais). Des fossiles ont plus tard été trouvés par quelqu'un dans une formation similaire à l'ouest de là, dans un autre comté. Cope a dit que c'était comme si ces fossiles provenaient de sa formation de Puerco, qu'il avait découverte. Sa falaise a peut-être été creusée par la rivière pendant longtemps et elle semblait être là depuis longtemps. C'était quelque chose que les scientifiques qu'il connaissait n'avaient pas vu avant lui. Dans le cadre de l'enquête Wheeler, il a pu faire ses achats dans des économats. Il a pu obtenir ses conclusions dans les rapports publiés dans le cadre de l'enquête. Il a emmené sa femme et sa fille lors d'un voyage de l'enquête, leur louant une maison. En tant que bénévole, il a payé son propre voyage. p63
Indépendance
Lorsque Cope a 35 ans, son père meurt, lui laissant un quart de million de dollars. p837 L'année suivante, en 1876, Cope quitte sa femme et sa fille de leur maison située près du verger de pommes à Haddonfield, dans le New Jersey, pour retourner à Philadelphie, en Pennsylvanie - cette fois dans une maison en rangée de la City. Il acheta deux unités et utilisa celle d'à côté comme paléo-laboratoire pour sa collection de fossiles. Il a cessé de travailler sur le terrain pour rattraper son retard dans l'écriture. Il a engagé des équipes pour chercher des fossiles pour lui. Et il a aidé l'exposition du centenaire de Philadelphie à mettre en place ses expositions de fossiles. p218 En 1877, il a pu acheter la moitié du naturaliste américain.
Il a publié des articles si rapidement que son rival, le professeur Marsh, a eu des doutes sur la date de découverte des fossiles de Cope. En août 1878, alors qu'il avait 38 ans, Cope s'est rendu dans les îles britanniques pour assister à une convention scientifique à Dublin, en Irlande. Il s'est ensuite rendu en France pour y assister à une convention scientifique de deux jours. Lors de l'une de ces conventions, il décida d'acheter des boîtes de fossiles argentins, peut-être pour le musée de Philadelphie.
Quand Cope est revenu, deux ans de collecte par son homme Lucas l'attendaient. Il s'agissait notamment d'un Camarasaurus, un sauropode. p42