Drosophila pseudoobscura est une espèce de mouche des fruits, largement utilisée dans les études en laboratoire sur la génétique des populations naturelles.
Il a été utilisé pour la première fois par Théodose Dobzhansky et ses collègues. Ils ont prélevé des échantillons sur des populations de l'ouest de l'Amérique du Nord et du Mexique, et les ont cultivés en laboratoire dans des "cages à population". Ils s'intéressaient à la sélection naturelle, à la dérive génétique et à d'autres aspects de la génétique des populations.
En 1989, Diane Dodd a donné aux populations de laboratoire de D. pseudoobscura deux types d'aliments différents, l'amidon et le maltose. Ils ont rapidement évolué en deux groupes distincts après seulement huit générations avec les différents aliments. Comme les deux groupes ont montré une forte préférence pour l'accouplement avec leur propre type, cela a été présenté comme un exemple de spéciation par isolement reproductif. L'expérience de Dodd a été répétée par d'autres, et fonctionne avec d'autres types de mouches à fruits et d'aliments.
En 2005, D. pseudoobscura a été la deuxième espèce de drosophile à voir son génome séquencé, après Drosophila melanogaster.

