L'île d'Hispaniola a été découverte par Christophe Colomb le 5 décembre 1492, mais la première fois qu'il a vu une partie de l'actuelle République dominicaine, c'était le 4 janvier 1493, lorsqu'il a vu un promontoire qu'il a appelé Monte Cristi ("Montagne du Christ"). Cette montagne s'appelle aujourd'hui El Morro et se trouve près de la ville de Monte Cristi.
De Monte Cristi, Christophe Colomb s'est rendu à l'est, le long de la côte nord de l'île, et le 6 janvier, après avoir visité la baie de Samaná, il est rentré en Espagne. Lors de son deuxième voyage en Amérique, il a fondé la première ville européenne du continent, La Isabela, près de la ville actuelle de Puerto Plata.
Plus tard, Bartholomée Colomb a fondé la ville de Saint-Domingue, la plus ancienne ville européenne permanente des Amériques. De là, de nombreux Espagnols sont partis à la conquête d'autres îles (Cuba, Jamaïque, Porto Rico). Comme Cuba était plus proche du continent, de nombreuses personnes s'y sont installées en provenance d'Hispaniola, puis sur le continent. De ce fait, la population de l'île a augmenté très lentement. Par le traité de Ryswick en 1697, l'Espagne a donné le tiers occidental de l'île à la France et a gardé la partie orientale, et l'île a donc eu deux colonies différentes : la Saint-Domingue française et la Saint-Domingue espagnole. En 1795, la France a obtenu la totalité de l'île, mais elle ne pouvait contrôler que la partie orientale car Haïti est devenue indépendante très rapidement. En 1809, le gouvernement français a rendu l'ancienne colonie de "Saint-Domingue" à l'Espagne.
Le 1er décembre 1821, le lieutenant-gouverneur espagnol José Núñez de Cáceres a déclaré l'indépendance de l'Espagne. Le nouveau pays porte le nom d'Estado Independiente del Haití Español ("État indépendant d'Haïti espagnol"). Mais le 9 février 1822, l'armée haïtienne occupe le pays et y reste pendant 22 ans. Juan Pablo Duarte fonde une société secrète, La Trinitaria, pour lutter pour l'indépendance dominicaine. L'occupation haïtienne prend fin le 27 février 1844, lorsque les habitants de la partie orientale de l'Hispaniola créent un nouveau pays appelé República Dominicana ("République dominicaine"). De 1861 à 1865, le pays est à nouveau une colonie espagnole. Le 16 août 1863 commence la guerre de restauration, lorsque les Dominicains se battent pour être à nouveau libres. Cette guerre s'est terminée en 1865 lorsque les Espagnols sont partis et que la République dominicaine est redevenue un pays indépendant.
Le pays a été occupé par les États-Unis de 1916 à 1924. En 1930, Rafael Trujillo est devenu le président du pays par un coup d'État. Trujillo était un dictateur cruel, tuant des milliers de personnes, dont de nombreux Haïtiens. Trujillo a été tué en 1961. Après la mort de Trujillo, Juan Bosch est élu en 1962 et devient, en 1963, le premier président élu depuis 1930. Mais il n'a été au pouvoir que pendant sept mois. En 1965, une guerre civile a éclaté entre ceux qui voulaient que Bosch revienne au pouvoir et ceux qui s'y opposaient. Puis le pays a été à nouveau envahi par les Etats-Unis.
Depuis la fin de la guerre civile, les présidents de la République dominicaine le sont :
- Joaquín Balaguer (1966-1978)
- Antonio Guzmán (1978-1982)
- Salvador Jorge Blanco (1982-1986)
- Joaquín Balaguer (1986-1996)
- Leonel Fernández (1996-2000)
- Hipólito Mejía (2000-2004)
- Leonel Fernández (2004-2012)