La méthylation de l'ADN est le principal moyen d'ajuster l'activité des gènes au cours de la vie, en particulier au cours des premiers stades du développement.
Il s'agit d'un processus par lequel des groupes méthyles sont ajoutés à l'ADN. Cela supprime la transcription des gènes. Deux des quatre nucléotides de l'ADN, la cytosine et l'adénine, peuvent être méthylés. Comme la méthylation de l'adénine est réservée aux procaryotes, toute la transcription des eucaryotes est régulée par la suppression de la cytosine.
La suppression des gènes est la base de l'épigénétique, l'étude des changements dans l'activité des gènes qui ne sont pas causés par des modifications de la séquence d'ADN. C'est l'étude de l'expression des gènes, la façon dont les gènes produisent leurs effets phénotypiques.
Les modifications de l'activité des gènes par méthylation peuvent durer toute la vie de la cellule, et de nombreuses générations de cellules par division cellulaire. Cependant, il n'y a pas de changement dans la séquence d'ADN sous-jacente de l'organisme. Au contraire, des facteurs non héréditaires font que les gènes de l'organisme se comportent (s'expriment) différemment.

