Zooxanthellae
Certains dinoflagellés sont des zooxanthelles : endosymbionts des eucaryotes marins, et des animaux tels que les coraux anthozoaires. Ces coraux constructeurs de récifs en dépendent largement. Parmi les autres organismes qui peuvent héberger des zooxanthelles, on trouve les méduses, les palourdes, les foraminifères, les limaces de mer, c'est-à-dire les nudibranches, ainsi que les ciliés et les radiolaires.
Marées rouges
Les dinoflagellés sont responsables des "marées rouges" qui peuvent empoisonner les poissons. Ils fleurissent parfois à des concentrations de plus d'un million de cellules par millilitre. Certaines espèces produisent des neurotoxines qui, dans de telles quantités, tuent les poissons et s'accumulent dans les filtreurs tels que les crustacés, qui à leur tour peuvent les transmettre aux personnes qui les mangent. Ce phénomène est appelé "marée rouge", en raison de la couleur que la fleur d'eau donne à l'eau. Toutes les proliférations de dinoflagellés ne sont pas dangereuses. Les scintillements bleutés visibles dans l'eau de mer la nuit proviennent souvent de la prolifération de dinoflagellés bioluminescents, qui émettent de brefs éclairs de lumière lorsqu'ils sont dérangés.
Classification
Bien que classés comme eucaryotes, les noyaux dinoflagellés ne présentent pas certaines caractéristiques essentielles des noyaux eucaryotes. En fait, Dodge a qualifié le noyau dinoflagellé de mésocaryote, en raison de ses caractéristiques intermédiaires entre les zones d'ADN enroulées des bactéries procaryotes et le noyau eucaryote bien défini. Ce groupe contient toutefois des organites typiquement eucaryotes, tels que les complexes de Golgi, les mitochondries et les chloroplastes.
Le groupe contient de nombreux organelles et styles de vie complexes. Certains ont des structures ressemblant plutôt à des yeux de vertébrés ; certains ont des nématocystes ; certains vivent sous forme de plasmodies (formes multinucléées) ; certains ont deux flagelles ; les dinoflagellés photosynthétiques contiennent un "éventail ahurissant" de types de plastides ; et l'ensemble de leur génétique et de leur biologie cellulaire est excentrique.
Fossiles
Les dinoflagellés fossiles sont importants pour la stratigraphie, la datation et la corrélation des strates. Au cours de leur vie, les dinoflagellés ont une forme planctonique mobile et une phase de kyste résistante qui leur permet de survivre pendant l'hiver dans les sédiments. Seul le kyste se fossilise. Leur première apparition certaine se situe au Silurien, avec un fort rayonnement au Mésozoïque. p440 Ils sont classés comme Phylum Dinomastigota par Margulis et ses collègues.
