Les cyanobactéries sont un taxon de bactéries qui effectuent la photosynthèse. Ce ne sont pas des algues, bien qu'elles aient été autrefois appelées algues bleu-vert. Il s'agit d'un phylum de bactéries, qui compte environ 1500 espèces. Selon la théorie des endosymbiontes, les chloroplastes (plastides) descendent des cyanobactéries. Leur profil ADN en est la preuve.
Les cyanobactéries ont un dossier fossile extrêmement long, commençant il y a au moins 3 500 millions d'années. Elles étaient les principaux organismes des stromatolithes des éons archéens et protérozoïques.
La capacité des cyanobactéries à effectuer une photosynthèse oxygénée est très importante. Au début, l'atmosphère terrestre était largement réductrice, c'est-à-dire sans oxygène. Les cyanobactéries des stromatolites ont été les premiers organismes connus à effectuer la photosynthèse et à produire de l'oxygène libre. Au bout d'un milliard d'années environ, l'effet de cette photosynthèse a provoqué un énorme changement dans l'atmosphère. Le processus, appelé "Grand événement d'oxygénation", a pris beaucoup de temps. Il a fini par tuer la plupart des organismes qui ne pouvaient pas vivre dans l'oxygène, et a conduit au type d'environnement que nous connaissons aujourd'hui, où la plupart des organismes utilisent et ont besoin d'oxygène.



