Un cil (pluriel de cils) est un organite que l'on trouve dans les cellules eucaryotes. Les cils sont de fines protubérances qui dépassent du corps cellulaire beaucoup plus grand.
Il existe deux types de cils :
- les cils mobiles, qui battent contre le fluide à l'extérieur de la cellule.
- les cils non mobiles, ou cils primaires, qui servent généralement d'organites sensoriels.
Chez les eucaryotes, les cils et les flagelles forment ensemble un groupe d'organelles appelé undulipodes. Les cils eucaryotes sont structurellement identiques aux flagelles eucaryotes, bien que des distinctions soient parfois faites selon la fonction et/ou la longueur.
Les cils de la moelle se trouvent sur les ciliés protistes comme le Paramecium. C'est ainsi que Paramecium se déplace. On les trouve également sur les cellules épithéliales de nombreux organes internes des métazoaires, tels que le système digestif et la trachée des poumons.

