Une rivière d'eaux noires est une rivière dont le cours profond et lent traverse des marécages boisés ou des zones humides. Sa couleur est causée par la végétation en décomposition. Lorsque la végétation se décompose, les tanins s'infiltrent dans l'eau, ce qui donne une eau transparente, acide et tachée de noir, ressemblant à du thé ou du café.
La plupart des rivières du bassin de l'Amazone et du sud des États-Unis sont des rivières d'eaux noires. Tous les fleuves sombres ne sont pas des eaux noires au sens technique du terme. Certaines rivières des régions tempérées, qui drainent ou traversent des zones de sol noir foncé, sont noires en raison de la couleur du sol. Ces rivières sont des rivières de boue noire ou des estuaires.
Les rivières d'eaux noires sont moins riches en nutriments que les rivières d'eaux vives et ont des concentrations ioniques supérieures à celles des eaux de pluie. Ces conditions uniques font que la flore et la faune diffèrent à la fois des rivières d'eau vive et des rivières d'eau claire.
La classification des rivières amazoniennes en eaux noires, claires et blanches a été proposée pour la première fois par Alfred Russel Wallace en 1853.
