En médecine, un effet indésirable est un effet nocif et non désiré qui résulte d'une thérapie comme un médicament, une chimiothérapie, une chirurgie ou une autre intervention. Un effet indésirable peut être appelé "effet secondaire" (lorsqu'il est moins important que l'effet thérapeutique).

Elle peut résulter d'un dosage ou d'une procédure inadaptés ou incorrects (qui pourraient être causés par une erreur médicale). Certains effets indésirables ne se produisent qu'au début ou lors d'un changement de traitement.