En 2002, les propriétaires du club ont décidé qu'ils voulaient déménager le club hors de Londres. Personne ne sait vraiment pourquoi ils voulaient déménager. Ils ont dit qu'il y avait trop de clubs à Londres, que les gens ne venaient pas en nombre suffisant pour assister aux matchs. Cela signifiait qu'ils ne collectaient pas assez d'argent à l'entrée pour payer tout le monde et c'est pourquoi ils ne pouvaient pas se permettre de rester. Ils se sont tournés vers Cardiff et Dublin avant de décider de déménager à Milton Keynes. Milton Keynes est une nouvelle ville qui se trouve à 45 miles (ou 75 kilomètres) au nord de Londres. Lorsqu'ils ont dit ce qu'ils voulaient faire, la plupart de leurs fans ont cessé de payer pour voir les matchs, ce qui signifie qu'ils avaient encore moins d'argent pour payer tout le monde.
Avant que le déménagement puisse avoir lieu, ils ont dû obtenir l'autorisation de la fédération de football (la FA). La FA est l'association de tous les clubs de football en Angleterre. Les clubs élisent un comité pour décider de la marche à suivre. La plupart des décisions qu'ils doivent prendre sont faciles à prendre, mais cela n'a pas été facile. Ou peut-être savaient-ils quoi décider mais ne voulaient pas être ceux qui le faisaient. Ils ont donc demandé à trois hommes intelligents d'étudier le problème et de leur dire ce qui serait le mieux à faire. Ces trois hommes ont dit que le club devrait être autorisé à se déplacer.
Certains membres du Comité n'ont pas aimé cette décision et ont essayé de l'arrêter. Mais les propriétaires de Wimbledon F.C. ont déclaré qu'ils feraient appel à un juge pour décider (dans un tribunal) si quelqu'un essayait de les arrêter. Cela coûte beaucoup d'argent d'aller au tribunal et celui qui perd doit payer pour tout le monde. Les autres clubs n'accepteraient pas de payer si cela se produisait, c'est pourquoi la FA a dû s'opposer à cette décision.
Mais il était déjà trop tard pour les propriétaires de Wimbledon F.C. Ils n'avaient plus d'argent. Ils avaient emprunté de l'argent à la banque pour continuer à vivre, mais maintenant la banque voulait récupérer son argent. Lorsque vous ne pouvez pas rembourser ce que vous empruntez, on appelle cela "faire faillite" et c'est ce qui s'est passé. Heureusement (ou malheureusement, cela dépend de votre point de vue), le groupe de Milton Keynes qui voulait d'abord qu'ils viennent, les voulait toujours. Ce groupe a donc remboursé une partie de l'argent et en 2002, le club a déménagé à Milton Keynes. Ils ont commencé à jouer dans le National Hockey Stadium, à côté de la gare centrale de Milton Keynes, et y sont restés pendant deux ans jusqu'à ce que leur nouveau stade soit prêt (2006).
De nombreux fans de football en Angleterre n'aimaient pas l'idée qu'un club puisse se déplacer. Ils pensent qu'un club appartient à une ville et que ce n'est pas comme un magasin de meubles qui ferme dans une ville et ouvre dans une autre ville. Une autre raison pour laquelle ils n'aiment pas cette idée est qu'ils aimeraient voir leur propre club entrer dans la Football League. La seule façon d'y parvenir est de remporter la ligue régionale, puis la conférence de football. Ils ont donc eu le sentiment que Milton Keynes "sautait la queue" pour entrer dans la Ligue. Pour cette raison, de nombreux fans ont refusé d'assister ("boycotté") aux matchs qu'ils jouaient
