La transphobie est tout préjugé ou discrimination fondé sur de mauvais sentiments à l'égard des personnes transsexuelles ou transgenres. Cela signifie également leur refuser la chance de participer à la société, d'avoir un emploi ou les forcer à se prostituer, et pas seulement les discours ou les crimes haineux à l'encontre de la personne transsexuelle. En 2009, pour interdire les crimes de haine contre les transsexuels, la loi Matthew Shepard a été adoptée et est entrée en vigueur par la reconnaissance du président Barack Obama aux États-Unis.
Le Haut Commissariat des Nations Unies pour les réfugiés souligne les demandeurs d'asile en raison de leur identité de genre ainsi que les principes de Jogjakarta. Mais une femme transgenre qui s'est échappée du Guatemala vers le Danemark a été placée dans un centre pour hommes et y a été violée. Elle risque à présent d'être renvoyée au Guatemala par le gouvernement danois.
La transphobie est courante dans le monde entier. On la retrouve également dans des mouvements de justice sociale comme le féminisme. Elle est surtout associée au féminisme radical. Transmisogynie" est un mot qui fait référence à la transphobie envers les femmes trans. Julia Serano l'a rendu populaire avec son livre Whipping Girl. Le cissexisme est parfois utilisé comme synonyme de transphobie, et la cisphobie est parfois utilisée comme son antonyme.